Zdarza się, iż u części pacjentów po zabiegach embolizacji występują objawy reakcji organizmu na zamknięte naczynie żylne i na stan zapalny wygenerowany w ten sposób. Stan zapalny jest częścią procesu zamykania naczynia embolizowanego i nie jest niczym nietypowy. Jeśli zabieg jest dość rozległy, to może się zdarzyć, iż występuje osłabienie organizmu (zwykle do 2-4 doby od zabiegu), zwyżka temperatury ciała (nie więcej niż 38 stopni) bóle i wzdęcie brzucha / podbrzusza – jak w czasie menstruacji (do 3-7 dni od zabiegu) czy pobolewanie pleców. Zdarza się również, iż w przypadku kobiet miesiączkujących, pierwsza menstruacja jest obfitsza. Zazwyczaj wszystkie następne są krótsze i mniej obfite. Wynika to z redukcji przekrwienia narządu rodnego po zabiegu embolizacji.

U mężczyzn objawy niepożądane po zabiegach embolizacji żylnej są zwykle słabiej wyrażone, zwykle ograniczają się do 2-4 dniowego obrzęku i bolesności w rzucie moszny. W tym przypadku wystarczy stosować się do standardowych zaleceń podawanych przez lekarza prowadzącego po zabiegu.